MKÜ Su ürünleri Fakültesi Pirinçlik Sağlık Bakanlığına ait tesislerde eğitim verirken 1996 yılında alınan karar ile kurulan Pirinçlik Meslek Yüksekokulu Rektör Prof. Dr. Şerefettin Canda’nın girişimi ile ek kontenjanla alınan 40 öğrencisi ile 13 yıl sonra eğitime başlayabildi.İskenderun Arsuz yolu 12. kilometre üzerinde Pirinçlik mevkiinde 1995–2000 yılları arasında Sağlık Bakanlığına bağlı atıl tesislerde Mustafa Kemal Üniversitesi Su ürünleri fakültesi eğitime başladı. 1996 yılında bölgenin denizcilik alanında okul için çok uygun olduğu konusuna karar verilerek, YÖK’e başvurarak Pirinçlik mevkiindeki bu tesislerde bir yüksek okul açılmasını önerildi. YÖK tarafından uygun görülen bu okul açılma izni almasına karşın Pirinçlik Meslek Yüksekokulu o günden bugüne bir türlü eğitim öğretime başlatılamadı. Sağlık Bakanlığı da Pirinçlik tesisin MKÜ’ye tahsisini onaylamadı. Bir süre eğitim yapan Su Ürünleri Fakültesi de tesisi boşaltmak zorunda kalmıştı. MKÜ Rektörü Prof. Dr. M. Şerefettin Canda, Mustafa Kemal Üniversitesi’nin gelişmesi, yeni programlar ve okullar açılması yönünde yaptığı hızlı çalışmalarda raflarda kalan, açılmayan dosyaları inceleyerek Pirinçlik Meslek Yüksekokulu’nun da açılmasına karar verdiği belirtildi. Ek kontenjan ile 40 öğrenci alan Yüksek okul İskenderun Turizm ve Otelcilik Meslek okulu binasında geçici olarak eğitime başladı.13 yıl aradan sonra Deniz ve Liman İşletme Programı ile eğitim öğretime başladı. Bölgenin ve Türkiye’nin ihtiyaç duyduğu, iş potansiyeli çok yüksek olan denizcilik bölümlerinde eğitimlerini sürdürmesi planlanan yüksekokulun bünyesinde şu bölümler bulunuyor:“Denizcilik Programları bölümü Güverte Programı, Gemi Makineleri İşletme Programı, Deniz ve Liman İşletme programı, Deniz Haberleşme Programı ve Yat işletme Programı”